Τόσο οι υπερπυκνωτές όσο και οι μπαταρίες είναι εξαρτήματα αποθήκευσης ενέργειας. Αλλά η διαδικασία αποθήκευσης ενέργειας των υπερπυκνωτών είναι μια φυσική διαδικασία, ενώ η αποθήκευση ενέργειας στις μπαταρίες είναι μια διαδικασία χημικής αντίδρασης, και οι δύο έχουν μια ουσιαστική διαφορά.

Τα χαρακτηριστικά ισχύος του υπερπυκνωτή είναι καλύτερα από αυτά της μπαταρίας, η οποία μπορεί να φορτιστεί και να αποφορτιστεί γρήγορα με μεγάλο ρεύμα. Η ενεργειακή πυκνότητα της μπαταρίας είναι υψηλότερη από αυτή του υπερπυκνωτή και η ενέργεια που αποθηκεύεται από την μπαταρία υπό τον ίδιο όγκο είναι μεγαλύτερη. Ο υπερπυκνωτής είναι ένα ενεργό υλικό με βάση τον άνθρακα συν αγώγιμο μαύρο άνθρακα και συνδετικό υλικό από ανάμεικτα ηλεκτρόδια, χρησιμοποιώντας πολωμένο ηλεκτρολύτη για την προσρόφηση θετικών και αρνητικών ιόντων στον ηλεκτρολύτη, σχηματίζοντας μια διπλή ηλεκτρική στρώση για αποθήκευση ενέργειας. Η διαδικασία αποθήκευσης ενέργειας ουσιαστικά δεν λαμβάνει χώρα ως χημική αντίδραση, επομένως η διάρκεια ζωής του κύκλου είναι πολύ μεγάλη, οι γενικοί χρόνοι φόρτισης και εκφόρτισης φτάνουν πάνω από 500.000 φορές, οι χρόνοι φόρτισης και εκφόρτισης της μπαταρίας είναι πολύ μικρότεροι, οι μπαταρίες μολύβδου-οξέος 500 φορές, οι μπαταρίες λιθίου 1000-1500 φορές, οι διαφορετικοί τύποι χρόνων φόρτισης και εκφόρτισης δεν είναι οι ίδιοι. Οι υπερπυκνωτές λειτουργούν σε θερμοκρασίες μεγαλύτερες από τις μπαταρίες - 40 έως 65 βαθμούς.

Η χρήση και των δύο είναι επίσης διαφορετική, η πυκνότητα ενέργειας του υπερπυκνωτή είναι χαμηλή, αλλά η εξαιρετική απόδοση κύκλου, η προστασία του περιβάλλοντος, η υψηλή ισχύς τον καθιστούν ευρέως χρησιμοποιούμενο σε εφεδρική τροφοδοσία, φόρτιση και εκφόρτιση υψηλής συχνότητας, υψηλή ισχύ εξόδου και άλλες περιπτώσεις, και η πυκνότητα ενέργειας της μπαταρίας είναι υψηλή, αλλά η ίδια η αρχή της περιορίζει τη διάρκεια ζωής της και η υπερφόρτιση και η υπερβολική εκφόρτιση θα προκαλέσουν μη αναστρέψιμο τραύμα σε αυτήν και δεν είναι φιλικές προς το περιβάλλον. Ωστόσο, ελλείψει εύρεσης εξαρτημάτων αποθήκευσης ενέργειας που μπορούν να αντικαταστήσουν μια τόσο υψηλή ενεργειακή πυκνότητα, το μέλλον εξακολουθεί να είναι ο κόσμος των μπαταριών (μπαταρίες ιόντων λιθίου) για μεγάλο χρονικό διάστημα, και μάλιστα θα αντικαταστήσει τη βενζίνη και άλλα καύσιμα για να γίνει η κύρια ροή κινητικής ενέργειας των οχημάτων.

Η σχέση μεταξύ των δύο είναι ότι τα πλεονεκτήματα της υψηλής ισχύος εξόδου του υπερπυκνωτή και η ικανότητα αποδοχής υψηλού ρεύματος φόρτισης και εκφόρτισης μπορούν να συνδυαστούν με την υψηλή ενεργειακή πυκνότητα της μπαταρίας ως βελτίωση στη διάρκεια ζωής της μπαταρίας και στην εξοικονόμηση ενέργειας των ηλεκτρικών οχημάτων.